З 1804 року в селі Боришківці існувала однокомплектна школа з трьома роками навчання. В різні роки вчителями школи були: Петринський, Сорока, Віницький, Тлускановський, Дубина С.М., Зущин Д., Болюба М. До 1930 року існувала трикласна народна школа. Щорічно в ній навчалося 90 – 100 дітей. У 1928 році школою завідував Зущин Д., побудував семикласне приміщення в центрі села. З 1930 року школа перейшла на семирічне навчання. Після Зущина Д. директором школи працював Дончак. У 1944 році школу відремонтували і знову почалось навчання. Директором став фронтовик Кобзіков Б.О. У 1967 році школа перетворена на 8 – річну трудову політехнічну.
Зусиллями директорів школи Решетюк К.М. та Криськової О.Г. У 1974 – 1984 рр. було добудоване приміщення на 5 класних кімнат, побудовано харчоблок, котельню, розширено майстерні та бібліотеку. З 1987 року школа перейшла на централізоване опалення. Школа стала окрасою села з чудово обладнаними та естетично оформленими кабінетами фізики, народознавства, мови і літератури, прекрасним спортивним майданчиком.
З 2001 по 2004 рік директором школи був Сушко О.І. В ці роки було обладнано кабінет інформатики. При школі відкрито дитячий садочок і школу було реорганізовано на НВК.
З 2004 по 2011 рік школу очолив Барановський В.Є. В 2011 році директором школи призначено Ільницьку С.М. В цьому році школу реорганізовано у ЗОШ І-ІІ ступенів. В 2013 році організовано підвіз учнів до школи шкільним автобусом.
13.08.2018 року Рішення сесій №1/9 «1. Про перейменування та зміну типу Боришковецької загальноосвітньої школи І-ІІ ступенів Кам’янець-Подільської районної ради Хмельницької області на Боришковецьку гімназію Слобідсько-Кульчієвецької сільської ради Кам’янець-Подільського району Хмельницької області»